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Nouveauté
Titre : | Amarrage moléculaires étude comparative entre deux algorithmes de recherche en utilisant hydroxylamine comme protéine cible |
Auteurs : | Ahmed Mostefa Mokhenane, Directeur de thèse ; Samia Sad, Auteur ; Idir LOULIA, Auteur |
Type de document : | texte imprimé |
Editeur : | [S.l.] : Université Sétif 1 Ferhat Abass, 2021 |
Format : | 73p / ill. / 31/21 |
Accompagnement : | CD ROM |
Langues: | Français |
Résumé : |
L’amarrage moléculaire fait aujourd’hui face à plusieurs défis dont l’absence de comparaison objective entre les différents algorithmes de recherche utilisés. Dans le travail ci-présent nous évaluons deux algorithmes du logiciel Molegro Virtual Docker : Moldock Optimizer et GPU Screening (CUDA), à travers une série de 30 redockings pour chacun en utilisant la 5hydroxytriptamine comme protéine cible. Les différentes poses obtenues sont ensuite
évaluées à l’aide des énergies de liaison, RMSDs obtenus ainsi qu’une analyse visuelle complémentaire avant de réaliser une comparaison entre les deux algorithmes. Nos résultats indiquent que le logiciel Molegro Virtual Docker est plus fiable, plus précis, plus performant et plus robuste avec l’algorithme GPU Screening. MVD présente toutefois plusieurs lacunes dont une faible performance dans le calcul de l’énergie de liaison ligand-récepteur pour le complexe fluoroquinolones-ADN gyrase et une mauvaise répétabilité dans le docking rigide de petites molécules |
En ligne : | https://drive.google.com/file/d/1y_1BhJVj5C5Ip8Ipo8ey02z05_RWTNKr/view?usp=sharing |
Exemplaires
Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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MPH/00579/21-1 | MPH/00579 | Mémoire | Salle des périodiques | Mémoires de Pharmacie | Exclu du prêt |